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Examen Bioquímica Jun 2011 – Biotecnología UFV

1) Preguntas tipo test: 5 puntos en total. 0.25 puntos/pregunta. Cada pregunta
incorrecta restará 0.08 puntos del total.

1. Sobre las interacciones no covalentes indique cuál de las siguientes
afirmaciones es cierta:

  • a. Son las responsables de la estructura primaria de cualquier biomolécula.
  • b. Todas ellas son direccionales.
  • c. Las fuerzas de London son las responsables de la interacción entre moléculas de H2O y moléculas hidrofóbicas.
  • d. Las interacciones dipolo permanente-dipolo inducido poseen una interacción de estabilización que depende de la distancia en un factor de 1/r5

2. Las sustancias hidrofóbicas situadas en un entorno acuoso tienden a la
asociación entre sí puesto que:

  • a. La entropía del sistema es menor cuando se forma un clatrato de gran tamaño que cuando se forman varios clatratos de menor tamaño.
  • b. Las moléculas de H2O tienden a buscar la mayor cantidad posible de interacciones con las moléculas hidrofóbicas.
  • c. Se maximizan las interacciones carga-dipolo inducido entre las moléculas hidrofóbicas y posibles iones presentes en la disolución.
  • d. Todas son falsas.

3. Nombre el monosacárido representado:

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  • a. D-fructosa.
  • b. D-Ribosa.
  • c. D-Galactosa.
  • d. D-Manosa.

4. Con respecto a los polisacáridos de función estructural:

  • a. La amilosa es uno de los más importantes y se compone de moléculas de α-D-glucopiranosas unidas por medio de enlaces O-glucosídicos de tipo α (1→4) formando un polímero lineal.
  • b. Los glucosaminoglucanos no cumplen un papel estructural.
  • c. Se caracterizan por estar formados, principalmente, por monosacáridos unidos por medio de enlaces O-glucosídicos de tipo α.
  • d. Se caracterizan por estar formados, principalmente, por monosacáridos unidos por medio de enlaces O-glucosídicos de tipo β.

5. El esqueleto glucídico del peptidoglucano bacteriano está constituido por:

  • a. N-Acetilgalactosamina y N-Acetilmurámico unidos por medio de enlaces O- glucosídicos de tipo β (1→6).
  • b. N-Acetilglucosamina y N-Acetilmurámico unidos por medio de enlaces O- glucosídicos de tipo β (1→6).
  • c. N-Acetilgalactosamina y N-Acetilmurámico unidos por medio de enlaces O- glucosídicos de tipo β (1→4).
  • d. N-Acetilglucosamina y N-Acetilmurámico unidos por medio de enlaces O- glucosídicos de tipo β (1→4).

6. Nombre el lípido representado:

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  • a. Galactosilceramida.
  • b. Glucosilceramida.
  • c. Fosfatidilinositol.
  • d. Fosfatidilglicerol.

7. Las translocasas presentes en las membranas plasmáticas de organismos eucariotas son proteínas encargadas de:

  • a. Equilibrar la composición de lípidos en ambas mitades de la membrana plasmática pues la síntesis de nuevos lípidos sólo tiene lugar en una de las mitades.
  • b. Transportar lípidos de una mitad a otra de la membrana empleando en dicho transporte el consumo de energía en forma de ATP.
  • c. Mantener la asimetría de membrana para preservar la funcionalidad de ésta.
  • d. b y c son ciertas.

8. La abreviación del ácido araquidónico se corresponde con:

  • a. 18:1cΔ9.
  • b. 18:2cΔ9,12.
  • c. 20:2cΔ9,12.
  • d. 20:4cΔ5,8,11,14.

9. El α-aminoácido representado es:

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  • a. Ala.
  • b. Val.
  • c. Leu.
  • d. Ile.

10. ¿A qué aminoácido se corresponde la valoración ácido base representada?

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  • a. Asp.
  • b. Gln.
  • c. Lys.
  • d. His.

11. Indique cuál de las siguientes afirmaciones sobre el enlace peptídico es falsa:

  • a. Posee un 60% de carácter de enlace covalente doble y un 40% de carácter de enlace covalente sencillo.
  • b. Se trata de un enlace químico que origina una amina.
  • c. Posee a nivel estructural carácter planar, principalmente.
  • d. En algunos casos, generalmente dependientes de secuencia, adopta una
    disposición cis.

12. Con respecto a la secuencia lineal de proteínas, indique la afirmación falsa:

  • a. Constituye el nivel estructural primario de cualquier proteína.
  • b. Dicha secuencia suele representarse de izquierda a derecha, constituyendo el extremo derecho el extremo N-terminal de la secuencia.
  • c. Las posiciones variables de la secuencia son aquellos que aceptan cambios conservativos.
  • d. Los dominios identificados por secuenciación de la proteína se corresponden, a su vez, con dominios estructurales con una función concreta.

13. Sobre la estructura secundaria de las proteínas, indique cuál de las siguientes
afirmaciones es cierta:

  • a. Las estructuras secundarias se estabilizan, principalmente, por medio de interacciones no covalentes de tipo carga-carga.
  • b. Las posibles estructuras secundarias vienen determinadas, sobre todo, por la naturaleza del enlace peptídico.
  • c. El ángulo de torsión φ se corresponde con el ángulo de giro en torno al enlace Cα-C.
  • d. El ángulo de torsión ψ se corresponde con el ángulo de giro en torno al enlace Cα-N.

14. La α-queratina:

  • a. Posee una estructura primaria consistente en repeticiones de tipo Gly-Ala.
  • b. La unidad estructural terciaria más básica es el dímero, constituído por dos hélices α enrrolladas la una sobre la otra en sentido levógiro.
  • c. Los dímeros se entrecruzan entre sí gracias a Lys hidroxiladas para dar robustez a la estructura global de la proteína.
  • d. b y c son ciertas.

15. Sobre el diagrama topológico representado:

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  • a. Representa un dominio de tipo α/β.
  • b. Se trata de un dominio de tipo sandwich β.
  • c. Contiene elevados niveles de Pro.
  • d. Todas son falsas.

16. Sobre la cooperatividad de la unión del O2 a la hemoglobina, indique cuál de las siguientes afirmaciones es cierta:

  • a. La unión del O2 al grupo hemo provoca un desplazamiento de los residuos
    HisF8 y ValFG5.
  • b. Provoca un aumento de la afinidad por el O2 en los capilares de los tejidos
    periféricos.
  • c. Al pasar de estado oxi- a estado desoxi-hemoglobina se produce un
    estrechamiento de la cavidad central de la estructura cuaternaria.
  • d. En el estado T (desoxi), la HisFG4 ó 97 de la cadena β2 se sitúa entre las
    TrhC6 ó 41 y ProCD2 ó 44 de la cadena β1.

17. Con respecto al parámetro enzimático KM:

  • a. Se trata de un parámetro constante de una enzima para cada posible sustrato.
  • b. Se trata de un parámetro constante para una enzima con independencia del
    sustrato.
  • c. Posee unidades de M-1.
  • d. Recibe también el nombre de recambio catalítico.

18. En la RNAsa A pancreática bovina:

  • a. Puede degradar tanto cadenas de ácido ribonucléico como de ácido desoxirribonucléico.
  • b. Son críticos los residuos His95 y Glu165 del bolsillo catalítico en el mecanismo de catálisis.
  • c. Se produce un ataque nucleófilo del O del C2 ́de la ribosa sobre el P del enlace fosfodiéster.
  • d. En el mecanismo de catálisis no participan las moléculas de H2O.

19. Identifique la base nitrogenada.

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  • a. Timina.
  • b. Citosina.
  • c. Uracilo.
  • d. Adenina.

20. Con respecto a la estructura secundaria de doble hélice del DNA:

  • a. Posee un surco mayor y un surco menor, el primero de ellos utilizado por las proteínas que se unen al DNA de manera secuencio-dependiente y el segundo de ellos utilizado por las proteínas que se unen al DNA de manera secuencio- independiente.
  • b. Una doble hélice con un contenido elevado en C/G ́s poseerá una temperatura de desnaturalización menor que aquella que posea un contenido elevado en A/T ́s.
  • c. El apilamiento de bases nitrogenadas en el interior de la estructura se estabiliza por medio de interacciones no covalentes de tipo dipolo permanente-dipolo permanente.
  • d. La única forma de doble hélice de DNA posible fue determinada por Watson y Crick en 1953 y recibe el nombre de forma B.

2) Preguntas cortas: 3 puntos en total. 1 punto/pregunta. Responda de manera breve y concisa.

1. Determine el pI del tripéptido Ala-Glu-Arg. Describa los equilibrios correspondientes sin olvidar representar las cadenas laterales de cada uno de los residuos de aminoácidos del tripéptido.

2. Describa el dominio representado e identifique los elementos de estructura supersecundaria de los que está compuesto. ¿En qué tipo de proteínas encontramos de manera característica dicho dominio?

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3. Describa los experimentos de Avery, MacCleod y McCarty sobre la naturaleza del material hereditario. ¿A qué conclusiones les permitió llegar dichos experimentos?

3) Pregunta a desarrollar: 2 puntos en total.
Desea realizar un estudio de actividad de las serínproteasas en su laboratorio de investigación y para ello tratará el dipéptido Lys-Ala con una de las serínproteasa para lograr su degradación en sus aminoácidos constituyentes. Dispone en el almacén de su laboratorio de las siguientes proteasas: Tripsina, Quimotripsina y Elastasa.
a. ¿Cuál de ellas emplearía para llevar a cabo la digestión? 0.5 pts.
b. Describa el mecanismo de catálisis empleado por la enzima. 1 pto.
c. Posee un mutante de la serínproteasa que vaya a emplear de tal manera que la Ser195 del bolsillo catalítico ha sido sustituída por una Val. ¿Será capaz dicho mutante de llevar a cabo la reacción de catálisis correspondiente? 0.5 pts.
d. Justifique todas sus respuestas.

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